1、房屋来源不同：房改房是国家对职工工资中没有包含“住房消费资金”的一种补偿，也就是国家对职工的一种工资性实物补偿。商品房的房屋来源，是具有经营资格的房地产开发商建成的房屋，是通过出让方式取得土地使用权。
2、价格不同：房改房的价格是由政府根据实现住房简单再生产和建立具有社会保障性的住房供给体系的原则决定的，是以标准价或成本价出售给职工的公房。商品房是市场经济条件下可进行交易的“商品”，其销售价格是由市场经济供求关系决定的。
3、销售对象不同：房改房的销售对象是有限制的，并不是任何人都可以享受国家房改优惠政策的，购买房改房的对象，只能是承住独用成套公有住房的居民和符合分配住房条件的职工家庭。商品房的出售对象是公开面向社会居民群体，根据其销售对象的不同，可以分为外销商品房和内销商品房两种。
4、购房面积不同：在房改售房中，对购房的面积是有所控制的，政府等部门有文件明文规定了人均可购房的建筑面积的“控制指标”，以防止一些人大量低价购买公有住房，造成国有资产的流失。商品房是可以按国家法律、法规，在市场上进行自由交易买卖的，购买者可根据自己的购买力，随心而定房屋的位置、楼层、结构和面积大小等内容。
5、优惠政策不同：购买房改出售的公有住房，是有一定的优惠政策的，公有住房的实际出售价格，是在“标准价”或“成本价”的基础上，还要进行工龄、职务或职称、家庭人口等多方面的优惠折扣。购买商品房没有优惠，还要面临限购政策。
6、出售条件不同：房改房在进入市场买卖时，是有限制的，出售给职工的公有住房，一般要在职工住用若干年以后，才可出售。同时，大部分房改房在出售时，原单位都保留了优先回购权。而商品房出售就没有要求限制了。
房改房可以买吗?
1、房改房可以买。最主要是要看产权人与原单位签署的原购房协议(或称买卖合同)中有没有特殊约定，如：房产要转让时单位有优先购买权，或只能出让给本单位职工等。如没有约定的话，就可以放心购买。
2、二手房市场上的房改房无外乎两种：完全产权和部分产权。
形成这两种房改房的原因，要追溯至当年的房改政策，当年职工参加房改购买房屋时，有市场价、成本价和标准价购房三种选择。当年按市场价购房的，产权归个人所有，可以随时上市买卖;按成本价购房的，产权归个人，但一般5年后才能进入市场买卖，买卖前要交纳土地出让金;按标准价购房的，职工拥有部分产权，具体按照当年标准价占成本价的比重来确定。
3、并非所有房改房都可以上市买卖。比如军队、保密单位、教育部直属高校的房改房，目前还不可以随便出售。
4、房改房买卖手续一定要注意产权过户必须报经房屋土地管理部门办理完毕才算完成。
其上市买卖的手续比一般的二手房买卖多了一道手续，即原户主夫妻双方须带房产证、身份证原件去房改办申请上市买卖，经过鉴定，拿到上市审批方可按二手房买卖程序进行买卖。
