南通二套房首付比例不低于40%。但是如果拥有1套住房并已结清相应购房贷款的缴存职工家庭，为改善居住条件再次申请住房公积金委托贷款购买普通自住房，最低首付款比例为30%。
南通买房政策
1、限购：不限购，本地人首套房享优先购买权。
2、限贷： 首次贷款首付30%，二套首付40%，三套停贷款。
3、限售：不限售。
南通公积金贷款规定
1、贷款期限贷款期限不得超过30年，最长可计算到借款申请人法定退休年龄后5年，最高不得超过65周岁。
2、首付比例目前南通公积金贷款买房首套房的首付比例为30%，首套房公积金贷款还清后，第二套房子才能够使用公积金，二套房首付比例为40%。
3、贷款要求连续缴存公积金满6个月(含6个月)可贷款。
4、贷款额度贷款额度为单人最高40万，两人(夫妻双方)最高80万。对二套房贷款实行“认房又认贷”，二套房最多贷60万元。
除此之外，南通的公积金政策还有这样的要求：
1、购买首套房，首付比例最低为20%，家庭名下在南通市(崇川区、港闸区、开发区)无房，5年内无公积金贷款记录。
2、购买二套，首付比例最低为60%，家庭成员名下在南通市(崇川区、港闸区、开发区)有1套住宅，且近五年内无住房公积金贷款还款记录;家庭成员名下无房但近5年内有1次公积金贷款记录;家庭成员名下只有1套住房，近五年内只有1笔住房公积金贷款还款记录，且该笔住房公积金贷款是用于购买前述名下住房的。
以下情况将实行公积金限贷政策：
1、南通市(崇川区、港闸区、开发区)，家庭名下有公积金贷款在还;
2、家庭成员名下近五年内有2笔(含)以上住房公积金贷款还款记录的;
3、家庭成员在南通市(崇川区、港闸区、开发区)有2套(含以上)住宅;
4、家庭成员名下有1套住房，近五年内有1笔住房公积金贷款还款记录，但该笔住房公积金贷款不是用于购买前述名下住房的。
