1、保障对象不同：
经济适用房的保障对象为当地城镇低收入住房困难家庭，并与廉租房保障对象相衔接。而限价商品房的保障对象为当地城镇中等收入以下住房困难家庭，即在房价不断高升以至于中等收入家庭都觉得安居困难的情况下，帮助中等收入家庭解决住房困难。
2、标准不同：
一般来说，经济适用房的申请人应具有当地户口；但限价商品房的申请人应为具有当地户口或持当地居住证的家庭和人员。另外，在申请人及家庭人均月收入应符合的标准上也不同，限价商品房的标准要较高于经济适用房的收入标准。
3、土地来源不同和销售价格确定方式不同：
经济适用房的土地为划拨方式取得，而限价商品房的土地取得方式为出让。经济适用房的销售价格是在开发企业办理销售(预售)许可证之前，由物价部门确定。而限价商品房的销售价格是在开发企业以出让方式取得土地前，在土地招拍挂文件中确定。
经济适用房买卖的注意事项
1、经济适用房政策明确说明，产权为有限产权，土地未办理有偿使用，不得出租，出借，5年内不得上市交易。在产权证书上应该标记为经济适用住房。如果不满五年就退出的，由市住房保障管理部门利用廉租住房专项资金进行回购，而回购的价格按照原出售价格每年扣减1%来计算。
2、在国家的政策下是有明确的规定，在购买了经济适用房后五年内不得交易，在经济适用房的明确规定下我们更能对一些想贪小便宜的人做到限制以及杜绝这种事情的发生。
3、如果是已经住满了五年的经济适用房，可以按照市场价格进行出售，但是出售后业主要按房屋成交额的10%补交综合地价款；而不满五年的则不能安装市场价格出售。而且把经济适用房出售后业主不能再购买经济适用房和其他保障性住房，不过如果以原价出售给有购买资格的人则可以再次购买。
4、这些明确规定的款项都是为了防止故意炒作房价以及对以不正规的手段得到房子进行交易的人的一个限制，让我们尽可能的直接杜绝掉这种可能的发生。在经济适用房的买卖政策上的目标是非常明确的，为一些低收入人群提供相对低的住所。
