首套房贷款已还清的情况下买二套房商业贷款最低首付40%，公积金贷款最低首付为30%。根据规定对拥有一套住房且相应购房贷款未结清的居民家庭购二套房，最低首付款比例调整为不低于40%。使用住房公积金贷款购买首套普通自住房，最低首付20%;拥有一套住房并已结清贷款的家庭，再次申请住房公积金购房，最低首付30%。
买房首套房的认定
1、贷款买过一套房，商业贷款已结清，再贷款买房——算首套。
2、贷款买过一套房，后来卖掉，通过房屋登记系统查询不到房产，但在银行征信系统里能查到贷款记录，再贷款买房——算首套。
3、全款买过一套房，再贷款买房——算首套。
4、全款买过一套房，后来卖掉了，房屋登记系统查不到房产，再贷款买房——算首套。
5、个人名下有两套房的商业贷款记录，全都已还清且出售，同时能够提供两套住房出售的证明，这种情况下再贷款时——算首套。
6、个人名下有一套房商业贷款已还清，另一套是公积金贷款已出售，同时能够提供住房出售的证明，申请商业贷款再买房——算首套。
7、夫妻两人，一方婚前买房使用商业贷款，另一方婚前购房用的是公积金贷款，婚后两人想要以夫妻名义共同贷款。若贷款已还清，银行业金融机构可以根据借款人偿付能力、信用状况等具体因素灵活把握贷款利率和首付比例。
8、夫妻两人，一方婚前有房但无贷款记录，另一方婚前有贷款记录但名下无房产，婚后买房申请贷款——算首套。
但是，这里需要额外指出的是，目前在贷款买房时，有些银行还会严格区分“首次购房”与“首套房”。
相对于首套房，首次购房标准更为严格，也就是说，此前既没买过房也没贷过款的，是标准的“首次购房”，购房的首付比例也会低于已有过购房经历的人。
比如，在实际操作中，个别银行出现对“首次”和“首套”不做具体审查的情况，均按首次购房执行20%的首付比例。但从严格意义上讲，“首次”房贷并不等于“首套”房贷。
鉴于“首次”房贷条件略优于“首套”，因此对于符合“首次”购房条件的，应不折不扣按“首次”政策发放贷款，以确保“首次”购房人群在购房时，能得到住房信贷政策的优先支持。
